Точная дата образования Ойротской государственной заводской конюшни не установлена, в архивных документах она упоминается, начиная с 1925 г. В 1926 г. переименована в Ойротский государственный конный завод.
На основании протокола № 3 заседания Президиума Ойротского облисполкома от 29 января 1932 г. Госконюшня в с. Кызыл-Озек была передана в ведение Коневодцентра. В 1930-1940-е годы в конюшне содержалось более 120 животных, из них 22 племенных жеребца английских пород и их производных (англо-арабских, англо-нормандских, англо-донских), 2 чистопородных донских жеребца. Поголовье производимых от племенных животных жеребят составляло более 1 тыс. в год, однако в тяжелые военные и послевоенные годы их численность сократилась почти втрое. Штат рабочих и служащих составлял 24 единицы.
На основании решения Алтайского крайисполкома № 6 от 3 января 1957 г. Горно-Алтайский облисполком решил организовать на базе Горно-Алтайской госконюшни государственную зональную станцию по племенной работе и искусственному осеменению сельскохозяйственных животных.
На основании решения Горно-Алтайского облисполкома № 505 от 27 декабря 1967 г., учитывая природно-экономические особенности области, а также в целях коренного улучшения племенных качеств лошадей из состава станции была выделена Горно-Алтайская госконюшня. Решение Горно-Алтайского облисполкома было закреплено решением Алтайского крайисполкома № 63 от 23 февраля 1968 г.
Постановлением Правительства Республики Алтай № 22 от 10 февраля 2005 г. «О реорганизации Государственного сельскохозяйственного учреждения «Горно-Алтайское» по племенной работе, Республиканского государственного учреждения «Онгудайская племенная станция» и Государственного учреждения «Горно-Алтайская заводская конюшня» было создано ГУ РА «Горно-Алтайский селекционно-племенной центр». На основании Постановления Правительства Республики Алтай № 141 от 16 мая 2014 г. Государственное Учреждение Республики Алтай «Горно-Алтайский селекционно-племенной центр» переименовано в бюджетное учреждение Республики Алтай «Специализированный центр содействия развития агропромышленного комплекса Республики Алтай».
Источники:
Госархив РА. Ф. Р-33. Оп. 6. Д. 31. Л. 21-22, Д. 170. Л. 277-278, Д. 339. Л. 294-296, Оп. 25. Д. 384. Л. 100, Ф. Р-689. Оп. 2. Д. 893. Л. 20-21, Д. 3006. Л. 211-212, Ф. Р-188. Оп. 1. Д. 187. Л. 1-2, Ф-1. Оп. 1. Д. 843. Л. 1.